Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms