Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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