Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rtf1A2AQ19 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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