Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms