Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms