Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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