Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms