Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpc2Q9R244 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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