Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf4Q9QZS2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf4Q9QZS2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf4Q9QZS2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf4Q9QZS2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf4Q9QZS2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf4Q9QZS2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Rnf4Q9QZS2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf4Q9QZS2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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