Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms