Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rabgef1Q9JM13 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rabgef1Q9JM13 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms