Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ldb3Q9JKS4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206 ms