Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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