Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl4Q9DCU6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms