Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ccdc97Q9DBT3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc97Q9DBT3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc97Q9DBT3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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