Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med27Q9DB40 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms