Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms