Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms