Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syf2Q9D198 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms