Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
ChtopQ9CY57 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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