Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms