Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdca4Q9CWM2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms