Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smim8Q9CQQ0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smim8Q9CQQ0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smim8Q9CQQ0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Smim8Q9CQQ0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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