Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ms4a8Q99N10 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ms4a8Q99N10 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ms4a8Q99N10 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ms4a8Q99N10 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ms4a8Q99N10 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ms4a8Q99N10 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms