Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtprtQ99M80 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprtQ99M80 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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