Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn16Q925N4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Cldn16Q925N4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Cldn16Q925N4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Cldn16Q925N4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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