Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms