Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pkn3Q8K045 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms