Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc38a2Q8CFE6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Slc38a2Q8CFE6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms