Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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