Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClasrpQ8CFC7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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