Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp44Q8C2S0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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