Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nhlrc2Q8BZW8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms