Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alkbh8Q80Y20 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms