Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Lrfn4Q80XU8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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