Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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