Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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