Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cspg5Q71M36 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cspg5Q71M36 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cspg5Q71M36 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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