Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Topbp1Q6ZQF0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms