Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trak1Q6PD31 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms