Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NipblQ6KCD5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
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