Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms