Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrhQ62361 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrhQ62361 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms