Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hcfc1Q61191 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hcfc1Q61191 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hcfc1Q61191 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hcfc1Q61191 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hcfc1Q61191 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hcfc1Q61191 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Hcfc1Q61191 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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