Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms