Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms