Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms