Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf608Q56A10 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms