Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Skap2Q3UND0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms