Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp19Q3UJD6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms